9 февраля 1942 года выходит приказ НКВД № 00249 «Об организации оперативного учета в особых отделах НКВД спецлагерей».
По вполне понятным причинам – с каждым годом все увеличивающимися потоками отвоевавшихся немцев – с 11 января 1945 года УПВИ реорганизовано в Главное управление по делам военнопленных и интернированных (ГУПВИ) НКВД-МВД СССР.
С другой стороны, на фоне крупных поражений вермахта на фронтах шла активизация со стороны спецслужб в направлениях разведывательной, диверсионной и террористической деятельности в тылах Красной армии.
Из управлений фронтов в ГУКР СМЕРШ НКО СССР постоянно шла и шла информация о разоблаченной вражеской агентуре, задержанных диверсантах и террористах. Так постепенно перед руководством 2-го отдела и Главного управления четко проступала тайная паутина разведывательных школ и диверсионных курсов гитлеровской Германии. Паучьи гнезда с лихорадочным постоянством готовили и забрасывали разными путями тысячи оперившихся и легших на крыло птенцов – шпионов, диверсантов и террористов в наши тылы. У них были вполне определенные цели: разведка, организация диверсий и физического уничтожения командиров и политработников с замахом даже на жизнь (пример «майора» Таврина и его сподвижницы «младшего лейтенанта» Шиловой (1944 г.)) Сталина и других руководителей Ставки Верховного главнокомандования (ВГК) страны.
Приказ НКВД СССР № 0016 от 11 января 1945 г. «О мероприятиях по очистке фронтовых тылов Красной армии от вражеских элементов и о назначении уполномоченных НКВД по фронтам». В нем говорилось:
«…Для обеспечения очистки фронтовых тылов действующей Красной армии от вражеских элементов
ПРИКАЗЫВАЮ:
1. Назначить уполномоченными НКВД СССР по фронтам:
– по 2-му Прибалтийскому фронту – комиссара госбезопасности 3 ранга т. Кубаткина (начальника управления НКГБ по Ленинградской области); заместителями: генерал-лейтенанта т. Железникова (начальник управления СМЕРШ фронта) и генерал-майора т. Абызова (начальник войск НКВД по охране тыла фронта);
– по 1-му Прибалтийскому фронту – комиссара госбезопасности т. Ткаченко (уполномоченный НКВД И НКГБ СССР по Литовской ССР); заместителями: генерал-лейтенанта т. Ханникова (начальник Управления СМЕРШ фронта) и генерал-майора т. Серебрякова (начальник войск НКВД по охране тыла фронта);
– по 3-му Белорусскому фронту – комиссара госбезопасности 2 ранга т. Абакумова (начальник Главного управления НКО СМЕРШ); заместителями: генерал-лейтенанта т. Зеленина (начальник Управления СМЕРШ фронта) и генерал-лейтенанта т. Любого (начальник войск НКВД по охране тыла фронта);
– по 2-му Белорусскому фронту – комиссара госбезопасности 3 ранга т. Цанаву (народный комиссар госбезопасности Белорусской ССР); заместителями: генерал-лейтенанта