В тридцатые годы весь ранее существовавший подбор колоколов был изъят. Но в 2006 году отлитые на заводе «ЗИЛ» колокола были переданы в дар черкизовскому храму, поэтому сегодня православных жителей Восточного округа Москвы на церковное богослужение вновь созывает колокольный звон.
В советское время в храмовое здание входили, как и положено, через западные двери лицом к алтарю, но в ограду храма можно было попасть только через южные ворота, со стороны Стромынской дороги. Сейчас тот же вход, с юга.
Исстари на праздник Крещения Господня шли крестным ходом через западные ворота к архиерейскому пруду, где устраивалась Иордань, происходило водоосвящение и купание православных. Но в настоящее время этот пруд уже не используется для этой цели, так как там начаты работы по его углублению и очистке. Власти города обещают соорудить мост, который свяжет находящиеся за прудом улицы микрорайона с храмом.
В советские годы черкизовский храм неоднократно собирались закрывать, одна из таких угроз нависла уже во второй половине прошлого столетия, когда на восточную окраину Москвы потянули линию метрополитена. Но чудом Божиим храм и в этот раз устоял.
Поскольку церковь то и дело собирались закрывать, она долго находилась без ремонта. Но когда состояние ее дошло почти до критического, власть, наконец, вспомнила об этом древнем памятнике архитектуры, который, как видно из таблички, прикрепленной к фасаду здания, охраняется государством.
В приходском архиве сохранился отчет за подписью архитектора Л. Ненаглядкина о ремонтных работах, выполненных в 1967 году. Тогда по составленной смете бригадой, возглавляемой А. Сажиной, были заменены разрушенные кровельные покрытия колокольни, четверика и трапезной.
В отчете говорится, что для проверки конструктивной устойчивости и золочения сняли кресты и подкрестные яблоки колокольни и четверика, из чего стало ясно, что металл на яблоках, выполненных из меди, несмотря на время, хорошо сохранился, поэтому там были пропаяны только швы. Но зато годы не пощадили гнезда для установки крестов, поэтому их пришлось полностью заменить. Сами деревянные кресты были заново обшиты листовой медью. Работы по ремонту и золочению яблоков и крестов проводились внизу, в закрытом помещении, а потом возвращены на прежнее место.
При