16 сентября 1896 года экспедиция прибыла в Архангельск, а 19 октября расформирована в связи с окончанием работ.
Проведенными работами была доказана возможность захода большетоннажных судов в гавань у протоки Луковая реки Енисей и далее плавания уже речных по Енисею до города Енисейска.
В 1898 году были возобновлены работы в Карском море, в районе устьев Оби и Енисея, для чего была образована Экспедиция Северного Ледовитого океана (ЭСЛО). Состав экспедиции составлял семь офицеров и 40 нижних чинов «при одном паровом судне и небольшом парусном ботике».
Так как пароход «Лейтенант Овцын» и парусная баржа «Лейтенант Скуратов» не совсем соответствовали требованиям океанского плавания, то в период командировки А. И. Вилькицкого в Англию с 16 февраля по 9 марта 1898 года был приобретен пароход, которому с одобрения императора Николая II дали имя «Пахтусов» (длина – 51 м, водоизмещение – 1140 т).
В начале августа 1898 года экспедиция под руководством полковника А. И. Вилькицкого на пароходе «Пахтусов» отправилась в Карское море из Архангельска.
4 августа 1898 года «Пахтусов» прибыл в пролив Югорский Шар (между Баренцевым и Карским морями), где были выполнены триангуляционные работы по всему проливу и в большей части – мензульная съемка в масштабе 1 миля в дюйме. В ходовых местах и на подходе к селу Никольскому был выполнен промер. Всего было выполнено 105 линейных верст топографической съемки и 214 линейных верст промера.
В результате работ экспедиции под руководством А. И. Вилькицкого в 1898—1901 годах были исследованы устья рек Печора, Енисей, южная часть Карского моря, а также составлены подробные карты этих районов.
Плавание ледокола «Ермак» под руководством С. О. Макарова к Шпицбергену в 1899 году
29 июня 1897 года вице-адмирал С. О. Макаров (будучи главным командиром и губернатором Кронштадта!) выехал из Санкт-Петербурга в Стокгольм, где познакомился с А. Э. Норденшельдом, от которого получил много сведений об арктических льдах. Из Стокгольма С. О. Макаров отправился в Гаммерфест, откуда на пароходе добрался до Адвент-бей (Лонгиербюэн) на Шпицбергене. Пароходом командовал Отто Свердруп, капитан судна «Фрам» в арктической экспедиции Ф. Нансена (1893—1896), у которого С. О. Макаров также узнал много полезного для задуманного им строительства ледокола для плавания в Северном Ледовитом океане.
По возвращении в Гаммерфест С. О. Макаров на пароходе