В письме к морскому министру адмиралу Павлу Васильевичу Чичагову Юрий Фёдорович Лисянский писал: «Предпринявши вояж вокруг света под командованием моего друга, я токмо ожидал минуты сего важного предмета, но в островах Маркизских всё превратилось в мечту. Там господин Резанов объявил публично, что он есть наш начальник. Рисковавши ежеминутно жизнью для славы нашего Государя и Отечества, возможно ли нам было ожидать командующего столь важной экспедицией, который пред сим почти не видел моря?»
Командир шлюпа «Надежда» Крузенштерн обратился в Главное правление Российско-американской компании и к министру коммерции графу Румянцеву с просьбой уволить его от командования судном «или из повеления того, от которого, кроме несчастного конца всех наших трудов, ничего ожидать невозможно». Губернатор Камчатки генерал Павел Иванович Кошелев прибыл в Петропавловск 12 августа с шестьюдесятью солдатами, которых взял с собой по требованию камергера Николая Петровича Резанова. Посланник в Японию Резанов в присутствии губернатора и десяти офицеров назвал Ивана Фёдоровича Крузенштерна бунтовщиком, разбойником, грозил ему казнью на эшафоте, а остальным офицерам угрожал вечной ссылкой в Сибирь. После таких оскорблений Крузенштерн сказал, что такие люди не могут командовать государевым кораблём. Попросил его сковать как преступника и отослать для суда в Санкт-Петербург. Посланник в Японию ничего слышать не хотел. Говорил, что поедет в столицу для присылки из Сената судей, а Крузенштерн пусть гниёт на Камчатке.
Иван Фёдорович пишет с горечью о Резанове: «Два года мучил он меня и караулил секунду, чтобы похитить честное имя моё. При всём страдании моём взял я всевозможное терпение, и я смело утверждаю, что никогда не отходил от правил честного человека».
Умный и честный генерал Павел Иванович Кошелев сумел примирить стороны.