Началась Корейская война (1950—1953 гг.). У Америки был план «Троян», предусматривающий нанесение по СССР массированного авиаудара по 20 советским городам, на которые планировалось сбросить 300 ядерных и 20 тысяч обычных бомб.
На совещании в Кремле в 1950 году Сталин предложил все работы по ракетам «Вассерфаль» закрыть и создать новую систему ПВО. И. В. Сталин поставил задачу: «Сделать оборону Москвы такой, чтобы через неё не мог проникнуть ни один самолёт противника. Мы должны получить ракету для ПВО в течение года». Подготовка соответствующего решения правительства о развёртывании этих работ была поручена Г. М. Маленкову и Л. П. Берие. Cтремительно началась подготовка этого Постановления. Все рекомендации И. В. Сталина, высказанные им, были реализованы в этом документе. До подписания Постановления Сталину необходимо было выяснить, что система «Беркут» способна отражать массированные налёты вражеской авиации. Получив положительный ответ на волновавший его вопрос, он поручил Л. П. Берие курировать все работы по разработке и созданию новой системы ПВО. Было подготовлено и утверждено Постановление Совета министров СССР от 9 августа 1950 года №3389—1426 сс/оп о создании ПВО городов и стратегических объектов страны. Системе присваивалось условное наименование «Беркут». Руководство проектом поручалось созданному под это Специальному комитету при Совете Министров СССР и лично Л. П. Берие.
Разработка первой отечественной зенитной ракетной системы «Беркут» предназначалась для круговой противовоздушной обороны Москвы. Система должна была включать 56 огневых комплексов, расположенных на двух бетонных кольцевых дорогах вокруг Москвы, удалённых на 45—50 и 85—90 километров от центра.
В Постановлении сказано: «Возложить руководство всеми работами по созданию системы «Беркут» на Специальный Комитет при Совете министров СССР, поручив товарищу Берия Л. П. принимать необходимые оперативные меры по обеспечению успешного выполнения задачи, поставленной настоящим Решением…». Совсем недавно Центральный архив РФ рассекретил этот ранее наиболее закрытый документ. Поскольку решение о создании московской системы ПВО было принято в середине года, то средства на разработку системы «Беркут» заранее не запланировали. Финансирование же этих работ по распоряжению Л. П. Берии происходило по линии Первого (атомного) Главного управления (ПГУ) при СМ СССР, находившегося под его эгидой.
Начальнику ПГУ Борису Львовичу Ванникову Берия поручил оказывать лично помощь в организации новой работы. Однако объем работ оказался весьма велик. Поэтому 3 февраля 1951года Постановлением Совета министров СССР №307—144 сс/оп было организовано Третье Главное управление при СМ СССР. Руководителем управления назначили первого заместителя министра вооружения СССР В. М. Рябикова.
На первом этапе