Снабжение советских войск оружием, боеприпасами, снаряжением и продовольствием осуществлялось боевыми кораблями Черноморского флота и частями транспортной авиации. Каждый раз при подходе к осажденному городу им приходилось прорывать блокаду.
2–6 июня, перед третьим штурмом Севастополя, в целях деморализации защитников города неприятель провел пятидневную авиационно-артиллерийскую подготовку[49]. Шквал огня обрушился на позиции осажденных. Вражеская авиация произвела свыше 9 тыс. самолето-вылетов, сбросив до 45 тыс. бомб, а артиллерия выпустила около 25 тыс. снарядов[50]. Однако это не сокрушило оборону.
После перегруппировки сил 11-я немецкая армия Манштейна 7 июня перешла в наступление. Для зашитников многострадального города русской славы, легендарного Севастополя, наступило самое тяжелое время. Ежедневно они отбивали по 15–20 атак превосходивших сил врага, нанося ему большой урон, но и сами несли немалые потери.
17 июня немцам все-таки удалось прорвать оборону на северном участке и в последующие шесть дней захватить все побережье бухты Северная, на юге они смогли продвинуться до подножия Сапун-горы. В ночь на 29 июня части одного из армейских корпусов на ста штурмовых лодках неожиданно форсировали Северную бухту и с первой попытки закрепились на ее южном обрывистом берегу. Утром немецкие части прорвали оборону в районе Сапун-горы и на следующий день на широком фронте вышли непосредственно к городу. В сложившихся условиях удержать Севастополь оказалось невозможно. В дивизиях оставалось всего по 300–400 человек. Оказать помощь героическим защитникам не могла и Ставка: к этому времени резко ухудшилась стратегическая обстановка в районе Харькова.
30 июня командующий Черноморским флотом Ф.С. Октябрьский доложил Ставке ВГК, что в рядах защитников Севастополя осталось примерно 5,5 тыс. боеспособных военнослужащих и около 15 тыс. раненых со всем медперсоналом. Гарнизон, по его оценке, мог продержаться максимум 2–3 дня. Ставка ВГК разрешила эвакуировать командный состав и гражданских ответственных работников. Часть из них убыла самолетами, в том числе и Октябрьский, а генерал Петров со своим штабом – на подводной лодке. Кроме того, с 22 июня по 1 июля включительно самолетами «Дуглас» были вывезены 2370 человек, из них 1411 раненых[51].
Остатки армии, флота и рабочих формирований, среди которых было много женщин, были сведены в отряды, возглавляемые генералом П.Г. Новиковым, продолжали сражаться и уничтожали материальную часть. К 7 июля возможности советских войск продолжать сопротивление иссякли. Часть воинов прорвалась в горы на соединение с партизанами. Довольно большая группа из войск прикрытия была прижата к морю и попала в плен. 7 июля было сломлено последнее сопротивление советских войск на полуострове Херсонес. В плену оказались 95 тыс. человек и 45 тыс. были убиты[52]. Общие потери с 30 октября 1941 г. по 7 июля 1942 г. составили 200 тыс.