Средняя черепная ямка, fossa cranii media, отделяется от задней черепной ямки верхним краем пирамиды височной кости и спинкой турецкого седла. Она образована телом и большими крыльями клиновидной кости, передней поверхностью пирамид, а также чешуей обеих височных костей. В средней черепной ямке различают непарную центральную (среднюю) часть, которая соответствует турецкому седлу, и по бокам – правую и левую латеральные части. В центральной части расположено углубление – гипофизарная ямка, fossa hypophysial. На латеральной поверхности тела клиновидной кости хорошо выражена сонная борозда, sulcus caroticus, а вблизи верхушки пирамиды височной кости видно рваное отверстие, закрытое хрящом. Между большим и малым крыльями клиновидной кости, а также ее телом находится верхняя глазничная щель, fissura orbitalis superior, через которую в полость глазницы проходят нервы: глазодвигательный (III пара), блоковый (IV пара), глазной (первая ветвь тройничного нерва – V пары) и отводящий (VI пара). Позади и чуть ниже верхней глазничной щели располагается круглое отверстие, foramen rotundum, через которое проходит верхнечелюстной нерв (вторая ветвь V пары). Находящееся рядом с предыдущим овальное отверстие содержит нижнечелюстной нерв (третья ветвь V пары). Остистое отверстие у заднего края большого крыла клиновидной кости служит для прохождения в череп средней менингеальной артерии.
На передней поверхности пирамиды височной кости у самой верхушки находится тройничное вдавление, позади и латеральнеекоторого располагаются расщелины каналов большого и малого каменистых нервов, а также их борозды, дугообразное возвышение и крыша барабанной полости.
Задняя черепная ямка, fossa cranii posterior, имеет большую глубину по сравнению со средней и особенно с передней ямками. Основу ее составляет затылочная кость. Кроме того, в состав задней черепной ямки входят задние поверхности пирамид и сосцевидные части височных костей, задняя часть тела клиновидной кости, сосцевидный угол теменной кости.
В центре ямки находится большое затылочное отверстие, впереди от которого располагается скат, clivus, образованный сращением затылочной и клиновидной костей. На скате лежат продолговатый мозг и мост. От заднего края большого затылочного отверстия к крестообразному возвышению, eminentia cruciformis, поднимается внутренний затылочный гребень. Отходящая вправо и влево от крестообразного возвышения борозда поперечного синуса, sulcus sinus transversi, продолжается в борозду сигмовидного синуса, sulcus sinus sigmoidei. Последняя располагается на внутренней поверхности сосцевидного угла теменной кости и сосцевидной части височной кости.