Несмотря на достаточно жесткую политику Фердинанда I, для Праги время его правления, а также правления его преемника Максимилиана II (1527–1576 гг., король Чехии с 1562 г., император Священной Римской империи с 1564 г.) стало периодом настоящего расцвета культуры и искусства страны. Средневековая готика постепенно сменялась новой архитектурой Ренессанса. Этот архитектурный стиль, зародившийся в Италии, основывался на возрождении традиций классической римской архитектуры. Характерными чертами его стали пропорциональность архитектурных форм, использование внешних колонн и рифленых пилястр, а главное, новый взгляд на эстетическое назначение зданий и их гармоничное сочетание с окружающим пространством.
Помимо нового стиля появились и новые формы декоративной отделки стен, такие как фреска – живопись по сырой штукатурке разведенными в воде красками, и сграффито – процарапывание рисунка по штукатурке, при котором обнажались более глубокие слои штукатурного покрытия.
В этот период новые здания создавались в основном иностранными мастерами, прежде всего итальянскими. Созданные ими росписи фасадов домов и дворцов, скульптурные украшения зданий и фонтанов преобразили Прагу, сделали ее более яркой.
В 1541 г. в Пражском Граде случился пожар, уничтоживший и повредивший большую часть зданий. Их восстановление проходило в стиле Ренессанса, и город постепенно превращался из укрепленного замка в современную королевскую резиденцию. Во Владиславовском дворце были построены западный и восточный фронтоны, был возведен новый королевский дворец и разбит сад в итальянском стиле. В 1564–1568 гг. был создан исключительной красоты фонтан, названный Поющим из-за звука падающих капель. Еще при Фердинанде I началось строительство Бургграфского, Рожумбергского и Лобковицкого дворцов, завершившееся при Рудольфе II (1552–1612 гг., император Священной Римской империи с 1576 г.).
Император Рудольф II
Эпоха правления императора Рудольфа II отразилась на городе весьма неоднозначно. В 1583 г. он, как и Карл IV, перенес императорскую резиденцию из Вены в Прагу, дав новый толчок экономическому развитию города. Образованность и высокая культура Рудольфа сыграли огромную роль в новом этапе развитии Праги. Король привлек к своему двору лучших европейских художников, скульпторов, музыкантов и ученых. Пражский Град снова стал императорской резиденцией, а также центром науки и искусства. Рудольф II был большим ценителем живописи и предметов прикладного искусства. Для хранения своих коллекций он даже расширил дворец, построив Испанский зал и Рудольфову галерею.
В 1584–1606 гг. в Пражском Граде был выстроен Северный дворец, придан современный вид Золотой улице, дома которой были пристроены вплотную к стене оборонительных