В США снижение смертности наблюдалось до 1980 г. За 1980—1992 гг. был зарегистрирован рост этого показателя на 58%, что было связано с «вновь возникшим» СПИДом и «возвратившимся» туберкулезом. В России была отмечена та же тенденция. Рост смертности начался с 1991 г. По сравнению со скандинавскими странами в 1992 г. смертность мужчин в России от инфекций была в 4 раза выше (Шевченко, Онищенко, 2001). Между 1989 и 1998 гг. заболеваемость сифилисом в России увеличилась почти в 55 раз (Сергиев В. П. и др., 2000). За 1991—1998 гг. заболеваемость туберкулезом в России увеличились в 2 раза. В настоящее время ежегодно от туберкулеза в России погибает больше людей, чем от всех других инфекций вместе взятых. Среди заключенных заболеваемость туберкулезом в 50 раз выше, чем среди населения России в целом (Покровский В. И. и др., 2003).
В последние десятилетия наблюдается эволюция инфекционных факторов. Непрерывно появляются новые штаммы бактерий, клоны вирусов, обладающих изменённой вирулентностью (способностью заражать) и патогенностью (тяжестью заболевания). Формируются новые возбудители инфекционных заболеваний. Возникает устойчивость к антибиотикам, вынуждающая разрабатывать новые и более сильнодействующие лекарственные препараты. Развитие лекарственной устойчивости – это, в значительной степени, результат направленной селекции микроорганизмов лекарственными препаратами в результате нерационального использования антибиотиков (Сергиев В. П. и др., 2000). Например, выявлена четкая корреляция между распространенностью резистентности стрептококков (Streptococcus pneumoniae) и уровнем продажи антибиотиков (Bronzwaer S. et al, 2002). Большинство известных антибиотиков также широко используются в животноводстве и птицеводстве, часто в субтерапевтических дозах, способствующих развитию резистентности. Ежегодно в мире производится 170 млрд тонн мяса, при выращивании которого применялись антибиотики (Шевченко Ю. Л., Онищенко Г. Г., 2001).
Другим механизмом формирования новых возбудителей выступает плановая иммунопрофилактика. В результате иммунологического пресса, вызванного массовой вакцинацией, происходят антигенные изменения в популяции возбудителя, и преимущественное распространение приобретают клоны (штаммы), не входящие в состав вакцин. В 1990-е гг. на фоне систематической вакцинации детей АКДС-препаратом с высоким охватом стали регистрироваться подъемы заболеваемости коклюшем в Австралии, Голландии, Канаде, США. Исследование циркулировавших штаммов выявило существенное изменение характеристик выделяемых от больных штаммов Bordetella pertussis no сравнению с допрививочным периодом. При сравнении с хранившимися музейными штаммами