В лекциях по психиатрии Балинский представил виды трудотерапии (садоводство, огородничество, хозяйственные работы) и показал ее значение для лечения душевнобольных; подчеркивал значение физической культуры для лечения душевнобольных, говоря о полезности продолжительных занятий на открытом воздухе. Он рекомендовал проводить с душевнобольными общеобразовательные занятия (чтение, письмо, рисование, науки), организовывать их досуг (игры, прогулки, музыка и пение, театр).
Врожденное самообладание ученого и искусство владеть собой давали ему возможность выстроить отношения с душевнобольными, быть для них доверчивым собеседником, всегда стремиться их понять. Всех поражало искусство Балийского управлять расстроенным умом и безумной волей.
И. М. Балинский как ученый и общественный деятель
Балинский имел не только глубокие знания и богатый клинический опыт в психиатрии, но придавал существенное значение таким наукам, как психология, физиология и анатомия мозга. Он собрал богатейшую библиотеку специальной научной литературы в области психиатрии.
Большая часть его научно-клинической деятельности состояла в демонстрации и тонком медико-психологическом анализе душевных болезней, которые он проводил в психиатрической клинике Медико-хирургической академии. Самостоятельная кафедра психиатрии с образцовой при ней клиникой, обязательный курс душевных болезней для студентов – это было новое слово в медицинской науке и практике не только в России, но и в Европе. Клиника при академии явилась колыбелью первой русской школы психиатров, образовавшейся под руководством Балийского.
И. М. Балинский не оставил печатных трудов. Обладая авторской скромностью и разумным скептицизмом, считал, что его научные материалы не являются законченными, что после него скажут гораздо лучше, опираясь на современные достижения науки. Необыкновенная сдержанность заставляла его чересчур строго относиться к печатному слову. Сикорский писал, что склад ума Балийского, его нравственный облик и деятельность как ученого представляют большой интерес и долг его учеников обрисовать личность Балийского и тем самым компенсировать следствие сдержанности и возвышенной скромности учителя.
В 1958 году были изданы его