В период 30-х годов прошлого века Особые отделы, а с февраля 1941 года 3-е Управление НКО СССР, не участвовали по большей части в репрессиях, так как работа по выявлению антисоветского элемента, вредителей и изменников в первую очередь ложилась на секретно-политические отделы НКВД, НКГБ СССР.
В то же время в 1930–1931-х годах на территории Киевского военного округа именно Особым отделом ОГПУ было заведено дело оперативной разработки «Весна», касающееся бывших офицеров царской армии. По материалам данного дела было уволено из рядов Красной Армии несколько тысяч человек, из этого числа в отношении десятков сотрудников возбуждены уголовные дела с окраской контрреволюционная деятельность. Большая часть расстрелянных командиров, проходивших по данному делу, были реабилитированы в 60-е годы ХХ века.
Имеющиеся архивные материалы по делу оперативной разработки «Весна» были тщательно проанализированы авторитетным историком отечественных спецслужб А. А. Здановичем. В своей работе «Органы государственной безопасности и Красная Армия. 1920–1934» автор, в частности, информирует: «Так всех бывших военнослужащих белых и националистических армий, арестованных в 1930–1931 годы в Москве, приговорили к высшей мере наказания (31 человек), приведя приговор в исполнение».
По его мнению, дело носило исключительно политическую окраску и вытекало из общей установки лидеров ВКП(б) к военспецам. В то же время у сотрудников Особых отделов было достаточно материалов, свидетельствующих об антисоветских настроениях и убежденности отдельных командиров Красной Армии в том, что в случае войны, социалистическая республика развалится.
Однако, как считает автор, антисоветские взгляды отдельных командиров не являются основанием для развязывания массового террора против воен спецов и фальсификаций по поводу их многочисленных единомышленников по всей стране.
А. А. Зданович высказывает мнение, что дело оперативной разработки «Весна» стало прелюдией к политическим процессам 1937 года.
Работу Особого отдела Киевского военного округа лично курировал председатель ОГПУ Менжинский, который указывал на «ошибки» военных контрразведчиков, и говорил о том, что «мягкотелость и недальновидность он будет выжигать каленым железом». Протоколы допросов по данному делу регулярно докладывались Генеральному секретарю ВКП(б) И. В. Сталину.
В 1934 году произошла серьезная реформа, затронувшая деятельность отечественных спецслужб. ОГПУ как орган разведки и контрразведки вошел во вновь образованный