После отступления в Новороссийск, последующей эвакуации в Крым, оставления генералом А. И. Деникиным поста Главкома ВСЮР и назначением новым Главкомом барона Врангеля, последний утверждает Ткачёва 1 апреля 1920 года начальником Управления авиации ВСЮР (28 апреля ВСЮР переименовывается в Русскую Армию). В своем обращении к летчикам белого Крыма Ткачёв заявил: «В тяжелое время и в тяжелой обстановке волею судьбы я поставлен во главе остатков некогда великой русской авиации». Вплоть до осени 1920 года авиация Русской Армии противостояла Красному Военно-воздушному флоту, а Врангель неоднократно отмечал роль Ткачёва, в том числе и в июньском разгроме красного конного корпуса Жлобы. Одним из первых Ткачёв был награжден орденом Святителя Николая Чудотворца 2-й степени.
После исхода Русской Армии из Крыма в Константинополь в ноябре 1920 года, Ткачёв обратился к своим летчикам, отдав последний приказ о возможной службе в авиации таких государств, которые не будут воевать с Россией, «а таким государством является только Югославия». С ним туда перебрались более 100 военных летчиков, летчиков-наблюдателей, авиатехников и мотористов. В эмиграции Ткачёв служил по контракту консультантом в инспекции Военно-воздушных сил Югославии, председательствовал в «Обществе русских офицеров Российского Военного воздушного флота» для оказания взаимопомощи военным летчикам, был редактором авиационного журнала «Наша стихия», участвовал в издании «Авиационного бюллетеня», писал статьи в югославские авиационные журналы, издал курс лекций «Тактика воздушных сил» (Белград, 1943), принимал участие в организации молодежно-патриотического движения «Русское Сокольство». В сентябре 1941 г. Ткачёв был назначен походным атаманом Кубанского казачьего войска и участвовал в формировании Русского Корпуса, инициированного фашистской Германией для борьбы с югославскими партизанами, однако сам никаких реальных шагов в его деятельности не предпринимал, и уже с 1942 года, окончательно отказавшись от сотрудничества с Русским Корпусом, работал начальником внешкольного воспитания русской молодежи в Белградских гимназиях.
После освобождения Красной армией Югославии осенью 1944 года, Ткачев добровольно явился к командованию, не чувствуя за собой никакой вины. Он был переправлен в Москву и 14 января 1945 года подвергся аресту Главным управлением военной контрразведки «СМЕРШ». Следствие было не долгим: 4 августа того же года по постановлению Особого совещания при МГБ СССР