Функционирование биологических механизмов заключается в том, что при выполнении определенных условий корректируется или полностью изменяется система актуализаций и дальнейшее поведение субъекта определяется целями, которые задает биомеханизм. При этом поведение субъекта может быть вполне осознанным (следует отметить, что осознанным будет любое поведение субъекта, если парадигма помещена в область когнитивной системы, именуемой сознание; можно утверждать, что субъект осознает только то, что помещено в сознание), но не произвольным в том смысле, что если когнитивная система и назначает какие-либо цели, то только в поддержку целей, определяемых активированным биомеханизмом.
Такими условиями могут быть фазы развития организма, оценка состояния окружающего мира, оценка текущего состояния субъекта в сообществе, оценка системы его отношений, оценка его информационного контента и пр.
Наиболее значимыми из них являются, по мнению автора, механизм выживания и механизм размножения.
А. Механизм выживания, который упоминался выше, действует практически постоянно, непрерывно контролируя жизнедеятельность организма. У примитивных организмов этот механизм действует в чистом виде, заставляя их искать пропитание, защищать свою жизнь, в том числе и за счет другой жизни. У организмов с более развитой когнитивной системой функционирование означенного механизма может в определенной степени камуфлироваться правилами, законами, нормами, традициями и пр., выражаясь в стремлении к повышению (или не ухудшению) общественного статуса субъекта, но в критических ситуациях, либо по оценке когнитивной системы либо на сигнальном уровне, при непосредственной угрозе для тела, вполне может проявиться в чистом виде, толкая субъекта на различные неосознанные (автоматические) антиобщественные и аморальные поступки (каннибализм, к примеру), т.е. в чистом виде механизм действует при отключенном сознании.
Б. Механизм размножения необходим для продолжения существования данного биологического вида. Следует отметить, что с точки зрения обеспечения выживания субъекта или организма появление новых особей данного вида порождает дополнительную конкуренцию в части территории обитания и источников жизнедеятельности. Более того, размножение может быть связано с гибелью, в том или ином виде, организма – поедание самками самцов после совокупления, да и простое деление организма на два новых организма означает исключение из процесса существования предыдущего организма. У высших организмов процесс размножения связан с периодом беременности самок, который как правило не слишком приятен и чреват нарушениями здоровья, а в дальнейшем снижением экономического статуса семьи, а зачастую и общим качеством жизни.
Механизм размножения как правило включается в период, именуемый периодом наступления