В исторических хрониках зафиксированы даты и места гибели байкальских судов. Из-за больших глубин эти затонувшие корабли до сих пор не найдены, но благодаря холодной пресной воде они могут идеально сохраниться до наших дней. В 1883 г. близ Ушканьих островов потерпела крушение и затонула парусная шхуна «Первенец». В 1888 г. затонул пароход «Николай», принадлежавший купцу A.M. Сибирякову, в 1900 г. – пароход «Лебедь» с 800 местами чая, в 1901 г. в сильный шторм разбилось в щепки о скалы мыса Кобылья Голова судно «Потапов». Рыболовецкий бот, занесенный песком, лежит недалеко от берега в бухте Загли (остров Ольхон). Баржа нерповщиков, выброшенная с мелководья, на мысе Верхнее Изголовье. Деревянный баркас был обнаружен в 2005 г. при прокладке кабеля на дне пролива Ольхонские Ворота. В 1983 г. напротив Красного Яра, в 500–600 м от берега, затонул катер «Академик Шокальский». Катер гидрометеослужбы шел без балласта, попал в сильный порыв ветра – горная, перевернулся и затонул на глубине около 1 км. До сих пор это судно не поднято на поверхность. В 1940 г. в бухту Фролиха упал гидросамолет. Судьба этих и многих других затонувших судов, самолетов, автомашин и места их точного нахождения на дне Байкала не установлены. По приблизительной оценке, со дна не поднято около 150 машин, ушедших под лед за прошедшие десятилетия.
Затопленный берег в пос. Листвянка, в результате строительства Иркутской ГЭС и последующего подъема Байкала приблизительно на 1 м, скрывает под водой старый причал из бревен, расположенный приблизительно на расстоянии около 100 м от современного пляжа. Напротив впадения в Байкал реки Крестовки раньше на дне находился остов затонувшего старого деревянного судна, предположительно «Феодосий», к настоящему времени уничтоженный волнами. Напротив пос. Листвянка на глубинах от 12 до 60 м лежат четыре якоря, два из них – 4-лепестковые, мощные, в рост человека, сплошь обросшие губкой и покрытые сильной коррозией, находятся рядом друг с другом. В подводных гротах на глубине 20–25 м дайверы закладывают на хранение бутылки с вином, среди них есть именные, например музыканта А. Макаревича. На 3-метровой глубине лежит загадочная чугунная 1,5-метровая пушка, неизвестно с каких времен и волей каких событий оказавшаяся на дне Байкала. Все эти исторические реликвии специально не поднимаются на поверхность, чтобы демонстрировать их при погружениях в Листвянке как музейные экспонаты подводной истории Байкала. При заполнении Иркутского водохранилища ушла под воду железнодорожная ветка Иркутск – порт Байкал на левом берегу Ангары. Здесь хорошо сохранились опоры мостов и подпорные стенки, сложенные из обтесанного камня в начале ХХ в.
Между пос. Листвянка и Б. Коты, в районе дайв-сайта «Средний», подводниками обнаружена на сегодня самая крупная на Байкале подводная