Указом консистории Воздвиженская церковь поступила в полное владение Алексеевской обители, с оставлением при ней бывшего церковного причта. Церковь в это время имела два престола, главный – в память Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня и второй, с левой стороны, – в честь Тихвинской иконы Божией Матери. В 1841 г. в церкви, справа от алтаря, был устроен стараниями игуменьи Иларии третий престол – во имя святого Алексия, человека Божия. При строительстве нового монастырского храма во имя святого Алексия, человека Божиего, придел этот в 1855 г. разрешили переименовать и назвать именем святого Симеона, епископа Персидского. Средства на устройство нового придела были завещаны генерал-лейтенантом Семеном Петровичем Степановым. Над его могилой в приделе горела неугасимая лампада.
Жители окрестностей стали во множестве стекаться в храм Воздвижения Креста Господня. Церковь в это время оставалась сырой и холодной, в ней «от многолюдства лило со стен и сводов». В течение нескольких десятков лет Алексеевский женский монастырь продолжал благоустраиваться на новом месте. В 1857 г. церковь Воздвижения Креста Господня была перестроена и существенно увеличена по проекту архитектора М.Д. Быковского. С севера к храму примыкала сохранившаяся шатровая колокольня. Крытая стеклянная галерея соединяла церковь с оградой. На западной стороне храма были устроены две монастырские ризницы. Однако до 1874 г. церковь оставалась холодной, в ней служили только летом. Наконец, игуменья Антония (Троилина) пригласила инженера Вертмана, который устроил в храме отопление с помощью изобретенной им духовой печи.
Храм Воздвижения Креста Господня имел богатые золоченые иконостасы; в главном приделе – четырехъярусный, в боковых приделах – двухъярусные. Были вызолочены глава и крест. Его закрыли около 1930 г. Ныне он перестроен до неузнаваемости, но внутри здания сохранились стены собора Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня.
Воздвижения Креста Господня в Алтуфьеве церковь (Алтуфьевское шоссе, дом № 147).
Первая церковь известна в этой местности с 1564 г. В 1687 г. был построен каменный храм. Современное здание возвели на средства владельца усадьбы Алтуфьево И.В. Вельяминова в 1759–1763 гг. Церковь освятили 30 октября 1763 г. Здание храма построено в стиле позднего русского барокко, «иже под колоколы», то есть колокольня