Индейцы по-прежнему оставались основными поставщиками пушнины. Гигантская прибыль, получаемая от торговли с индейцами, представлявшей собой в лучшем случае неэквивалентный обмен, а то и просто ограбление путем спаивания, и составляла суть процесса первоначального накопления капитала в этой части Северной Америки.
Индейцы в погоне за пушниной постепенно, но неуклонно отходили от свойственного им оседлого образа жизни, занятия земледелием и собирательством, охотой и рыболовством. Колонисты упорно навязывали индейцам несвойственную им форму экономической жизни – охоту только на пушного зверя. И, как следствие, нарушился образ жизни индейских племен, основанный на первобытно-общинных отношениях.
На землях к югу от Великих озер, населенных ирокезами, почти полностью исчезли бобры и другие пушные звери из-за хищнического их истребления. Ирокезы, вынужденные искать новые земли, богатые пушным зверем, двинулись на северо-запад, где жили племена гуронов.
Однако французские колониальные власти не желали допустить утечки ценных мехов к купцам Новой Голландии, поэтому всячески мешали гуронам и ирокезам договориться между собой о распределении охотничьих угодий. Особенно рьяно проявили себя иезуиты. Следствием этого стали несколько опустошительных военных набегов, совершенных ирокезами с конца 30-х до середины 60-х гг. XVII века в глубь территории, населенной гуронами. В результате вся местность, именуемая тогда Гуронией, была почти полностью разорена, большинство проживавших там индейцев уничтожены, а заодно и стерты с лица земли все католические миссии, основанные там иезуитами.
Из-за постоянной угрозы нападения ирокезов, а также неумения и нежелания торговых компаний наладить экономическую жизнь колонии Новая Франция испытывала упадок и поэтому в 1663 г. была присоединена непосредственно к королевскому домену. Управление колонией было реорганизовано. Так, помимо губернатора, официального наместника короля и главы вооруженных сил колонии была введена должность интенданта. Последний руководил экономикой колонии и занимался всеми вопросами, связанными с ее внутренней жизнью. Также был введен пост епископа, который ведал всеми религиозными делами колонии. Это отражало стремление властей метрополии укрепить в Канаде положение галиканской католической церкви, поддерживающей абсолютистский режим, и таким образом пресечь любые ультрамонтанские и теократические тенденции, выражаемые в колонии прежде всего иезуитами.
Для второй половины XVII века характерно военно-политическое, экономическое и культурное доминирование Франции в Европе, что отразилось и на методах французской колониальной политики и на самом развитии колонии Канады в этот период. Так, социально-экономический и политический строй в Новой Франции имел тенденцию к укреплению.
Правительство метрополии хотело сделать колониальную экономику более рентабельной и усилить контроль