Зять Чингисхана Тогачар-куреген прибыл с великими эмирами и десятью тысячами человек авангарда, Толуй-хан в середине месяца рамадана (ноября) и подъехал к воротам Нишапура. Жители города оказали сопротивление с отчаянной храбростью, так как видели своё численное превосходство, а число могуллов было небольшим, они предпринимали частые вылазки и вступали в бой. На третий день они отчаянно сражались в башне Кара-Куш и пускали стрелы из луков и самострелов со стен и земляных валов. Одна стрела насмерть поразила Тогачара, жители города убили его, не зная, с кем они имели дело. Могуллская армия отступила, а два сбежавших пленника пришли в город с новостью о смерти Тогучара. Люди подумали, что они совершили великое дело, не осознавая к каким последствиям это приведёт. Таким образом участь Нишапура была предрешена.
Помощник Тогачара Борке-нойон разделил армию на две части. Одну часть возглавил сам и направился к Сабзавару, который он занял после трёхдневного боя, приказав перебить всех жителей. При похоронах насчитали семьдесят тысяч трупов. Вторая половина армии выступила к Тусу на помощь Куш-Темуру и захватила часть крепости, которую не могло взять войско Куш-Темура. Отчаянное сопротивление населения Нукана и Кара с бесчисленными чудесами доблести им не помогло, в конце концов могуллы взяли Кар и убили всех его жителей. Города Нукан и Сабзавар были захвачены 28 числа (месяца рамадана 26 ноября 1220 года), а жители истреблены.
Жители Нишапура открыто подняли бунт и, при подходе могуллских подразделений, высылали отряды для их захвата.
Цены в Нишапуре стали очень высокими, а жителям было запрещено покидать город, поэтому большинство терпели лишения и страдали от голода.
К весне 618 (1221—1222) года и Толуй-хан покончил с Мервом и выдвинулся в Нишапур, о его приближении в городе не знали. Он собрал такое огромное войско, что в районе Туса они захватили все селения одним ударом и жестоко расправились с жителями. Вместе большой армией к Шадияху заблаговременно были направлены камнемётные орудия и другие вооружения. Несмотря на то, что Нишапур находится в каменистой местности, они загрузили большое количество камней для камнемётных орудий за несколько перегонов до города и везли их с собой в большом количестве,