Ткаченко С.А. освобождается от занимаемой должности командира и военкома 79-го стрелкового полка и зачисляется в распоряжение Управления по начсоставу РККА. В феврале-марте 1937 года дело Ткаченко решается положительно, ареста не последовало, и 19 марта он назначается помощником командира по строевой части 53-го стрелкового полка 18-й стрелковой Ярославской Краснознаменной дивизии Ленинградского ВО г. Петрозаводск. 19 июня 1938 года Ткаченко назначается помощником командира 31-й стрелковой Сталинградской дивизии Закавказского ВО г. Астрахань. С 19 августа 1939 года помощник командира 28-й горно-стрелковой Горской Краснознаменной дивизии им. В.М.Азина. В начале января 1940 года полковника Ткаченко неожиданно вызвали в Наркомат обороны, где ему было объявлено новое назначение – командиром 44-й стрелковой Киевской Краснознаменной дивизии. Эта дивизия, принимавшая участие в советско-финляндской войне, в первых числах января была разбита финнами на дороге Раате недалеко от финского поселка Суомуссалми. 8 января 1940 года вышел приказ о назначении С.А. Ткаченко (Приказ НКО №048). В дивизию он прибыл и вступил в командование 13 января 1940 года. Это было сложное время, как для Семена Акимовича Ткаченко, так и для бойцов и командиров 44-й дивизии. Потери дивизии были огромны. Так, в "Книге памяти" советско-финляндской войны указано, что только в период с 1 по 6 января в 44-й дивизии: погибло около 1,5 тыс. человек, свыше 1,5 тыс. человек получили ранения и более 2,5 тыс. человек пропало без вести, а всего с учетом больных и обмороженных выбыло из строя около 6 тысяч человек. При выходе из окружения на финской территории было оставлено почти все вооружение, военная техника и имущество. По сути, дивизию пришлось формировать и укомплектовывать заново. 11 января 1940 года, по приговору Военного трибунала 9-й армии, перед строем дивизии были расстреляны: командир дивизии комбриг А.И. Виноградов, начальник штаба дивизии и начальник политотдела. В журнале боевых действий дивизии со всей эмоциональностью того времени была сделана запись: "…Изменников, предателей родины бандитов, которые довели дивизию до временного поражения Виноградова, Волкова Пахоменко – расстреляли". Однако репрессии коснулись не только командования дивизии, но и бойцов и командиров низшего звена. В период с 11 по 29 января было проведено еще 17 судебных заседаний, в ходе которых к расстрелу были приговорены 1 воентехник и 8 красноармейцев. К лишению свободы сроком на 10 лет – семь красноармейцев и один командир взвода. Вот в таких условиях полковник Ткаченко вступил в командование дивизией, вот на таком фоне восстанавливалась ее боеспособность. Один из бывших командиров впоследствии вспоминал, что С.А.Ткаченко в этот период побеседовал буквально с каждым командиром, лично расставляя командиров по должностям в подразделения: "При прибытии полковника Ткаченко С.А. в дивизию в январе 1940 г. началась жизнь дивизии. Я тоже был на исповеди у генерала. Спрашивал, где я был во время гибели дивизии. Хочу добавить, что все командиры, солдаты любили генерала Ткаченко". В дивизии начались
