Постепенно Россия приближалась к Европе, чтобы в конце 1860 года войти в среду европейского рынка. Ликвидация традиционного российского бездорожья стала одним из важнейших вопросов в наивысших правительственных инстанциях. Украинский хлеб нужно было вывозить. Россия успевала через южные порты пропускать только около трех миллионов четвертей пшеницы, а стремилась довести свой экспорт до 10 миллионов. Об этом писали царю земельные магнаты, не теряя надежды заявить о себе в европейской торговле. Кроме торговли, строительство железной дороги в направлении моря имело и стратегическую цель.
Ко всему иному во второй половине XIX столетия, Подольская губерния становится центром сахарной промышленности царской России, что также привело к потребности строительства железной дороги для доставки сахара в центры империи. К тому времени в губернии числилось 29 сахарных заводов.
Новый руководитель путей сообщения царской России энергичный генерал П.Мельников создал проект сети главных путей европейской России, в том числе от Москвы до Одессы. Строительство колеи от Киева на Одессу через Козятин, Жмеринку, Балту возглавило общество «Де-Вриер и К°», которое строило эту железную дорогу простым подрядным методом. По условиям рельефа железная дорога прошла через лес между селами Большая и Малая Жмеринка. В 1866 году император утвердил строительство железной дороги от Киева до Балты с ветками к Волочиску и к Бердичеву. Особая роль в этом проекте была уделена узловым станциям.
Наиболее выгодной для построения узловой станции, которая соединяла направления Волочиск-Козятин-Бердичев, стала территория между селами Большая и Малая Жмеринка. Этому содействовало то, что произошла отмена крепостного права, которая по времени совпала с довольно-таки масштабным строительством железной дороги. За царским указом для ее строительства отводились земли из владений разных собственников. В 1886 году у общины села Большая Жмеринка для строительства Киево-Балтской железной дороги было на платной основе изъято больше 38 десятин земли.
В связи со строительством железной дороги Киев – Балта в 1865 была основана Жмеринка, как большая узловая станция Правобережья. Станция располагалась между селами Малая и Большая Жмеринка на месте вырубленного дубового первобытного леса. Движение поездов по железной дороге Одесса – Жмеринка – Киев начался 8 июня 1870 года, по железной дороге Жмеринка-Волочиск – в сентябре 1871 года, по железной дороге Жмеринка-Могилев-Подольский – 30 сентября 1892 года. Жмеринский вокзал построен на переходе от XIX к ХХ столетию. Он внесен в 1999 году в реестр государственных архитектурных памяток национального достояния.
«При станции Жмеринка образовался поселок, частью составляющий железнодорожную колонию, а частью – вызванный к жизни спросом на разного рода услуги» со стороны железнодорожного персонала. Само местечко Жмеринка находится в двух верстах от станции и носит название Малой Жмеринки» – читаем в книге П.Н.Андреева «Иллюстрированный путеводитель по Юго-Западным казенным железным дорогам» – Киев. – 1899 г.
Статус города Жмеринка получила 18 ноября 1903 года. В 1904 году были определены его границы, а с 7 января 1905 начало действовать городское управление. Первым городским старостой был избран дворянин Карл Викентьевич Вронский. Свое название Жмеринка получила от сел расположенных по обе стороны от железнодорожного пути – Большая и Малая Жмеринка. Что же к происхождению самого названия, то существуют разные версии. Одни исследователи считают, что оно происходит от польского выражения «жму руку», сказанному при встрече двух победителей. Другие усматривают ее в том, что на территории современного города было поселение, в котором жилы гончары, которые с глины изготовляли разную посуду – «жали рынки». Еще есть гипотеза, которая утверждает, что «джемери» – это густой темный лес, чащи, на месте которого возникли эти поселения.
Но наиболее вероятной есть следующая версия. Древнегреческий историк Геродот свидетельствует, что подольская земля была известная миру еще за пять веков до нашей эры. Он упоминает алозонов и невров, которые заселяли эти земли. С его работ мы узнаем, что юг Украины в те далекие времена населяли киммерийцы, которых ассирийцы называли «GIMMIR» (или «ГИММИР»). В украинском языке (как и в других славянских языках) звук «ж» чередуется со звуком «г». Возможно, отсюда и пошло название поселений наших далеких предков. Оно сохранилась в названиях подольских поселений Чемеринцы, Чемер, Чемерисы, в названии травы чемерицы, одежды-чемерки, а, возможно, со временем в названии поселения – Жмеринка.
Исторические корни города Жмеринки генетически определяются двумя соседними селами – Большой и Малой Жмеринками. Размещение же узловой станции не в поселке Браилов, или в другом месте, было связано с известными супругами Карлом и Надеждой фон Мекк. Их имение находилось в Браилове (ныне там профтехучилище). Карл проектировал железную дорогу, которая строилась. Он хотел узловую станцию разместить поближе к своему имению и своим замыслом поделился с женой. Мудрая Надежда